停工留薪期由所属区域的劳动能力鉴定委员会确认。以下是对此问题的详细分析：

一、停工留薪期的定义与性质

停工留薪期是指员工因执行工作而遭受到意外事故，或因患有职业病需要暂时停止工作以接受工伤医疗的一段时期。在此期间，员工原本享有的工资福利待遇应保持不变。

二、停工留薪期的确认部门

1. 一般情况：通常情况下，停工留薪期由所属身份区域的劳动能力鉴定委员会依据相关法规及规定来最终决定。
2. 特殊情况：若用人单位与员工对于停工留薪期的期限存在异议，可依法申请劳动仲裁解决。

三、停工留薪期的相关流程与规定

1. 工伤认定申请：用人单位有责任从员工受伤之日起的第三十个自然日之内，向统筹地区的社会保险行政部门提交工伤认定申请。
2. 劳动能力鉴定：若经过治疗之后，伤势状况相对稳定且对劳动能力产生了影响，则需进行劳动能力鉴定。劳动能力鉴定委员会在进行鉴定过程中，将同时确定停工留薪期的具体期限。
3. 最长时限：停工留薪期一般不超过12个月。伤情严重或者情况特殊，经设区的市级劳动能力鉴定委员会确认，可以适当延长，但延长不得超过12个月。即停工留薪期总计最长不得超过24个月。

四、注意事项

1. 及时申请：用人单位应按时提交工伤认定申请，以确保员工的合法权益得到保障。
2. 保留证据：员工应妥善保留与工伤相关的所有证据，以便在需要时进行维权。
3. 异议处理：若对停工留薪期的期限存在异议，应及时通过法律途径解决。

综上所述，停工留薪期的确认部门为所属区域的劳动能力鉴定委员会。在确认过程中，应遵循相关法规及规定，并确保员工的合法权益得到保障。如有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请直接向我咨询。