公司还在经营是可以申请注销的。不过，注销公司需要遵循一定的法定程序和条件。

详细分析：

1. 注销的合法性：

   • 公司注销是企业合法退出市场的一种方式。如果公司决定不再继续经营，或者出现其他需要终止的情形，如股东决定解散、公司被依法吊销营业执照等，都可以申请注销。

2. 注销的程序：

   • 注销公司需要按照法定程序进行，这通常包括清算、公告、税务注销、工商注销等环节。
   • 在清算过程中，公司需要清理债权债务，确保资产能够清偿债务。
   • 公司还需要向相关部门提交一系列的申请材料，如注销申请书、股东会决议、清算报告等。
   • 各部门会对提交的材料进行审核，审核通过后，公司就可以完成注销手续。

3. 注销的注意事项：

   • 注销公司是一个严肃的法律行为，一旦完成注销，公司的法人资格即告终止，不得再继续进行任何经营活动。
   • 在注销过程中，公司需要确保所有债权债务都已妥善处理，以避免后续的法律纠纷。

总结与建议：

综上所述，公司在经营过程中是可以申请注销的，但需要遵循法定的程序和条件。如果您有注销公司的需求，建议咨询专业律师或相关机构，以确保注销过程的合法性和顺利性。同时，也需要注意注销后的法律后果，避免因为注销不当而引发后续的法律问题。