侵占、破坏种质资源，将受到县级以上人民政府农业、林业主管部门的处罚，包括责令停止违法行为、没收种质资源和违法所得，并处五千元以上五万元以下罚款；造成损失的，还需依法承担赔偿责任。

一. 法律依据

1. 《中华人民共和国种子法》第八条：国家依法保护种质资源，任何单位和个人不得侵占和破坏种质资源。禁止采集或者采伐国家重点保护的天然种质资源。
2. 《中华人民共和国种子法》第八十一条：违反本法第八条规定，侵占、破坏种质资源，私自采集或者采伐国家重点保护的天然种质资源的，由县级以上人民政府农业、林业主管部门责令停止违法行为，没收种质资源和违法所得，并处五千元以上五万元以下罚款；造成损失的，依法承担赔偿责任。

二. 处理流程

1. 受案：通过举报、日常检查或者其他机关移送的违法案件等，发现违法行为，受理案件并制作受案登记表。
2. 调查取证：对受案的案件，指定专人负责，及时组织调查取证，通过搜集证据、现场了解核实情况等进行调查。
3. 处理：对违法行为事实、证据等方面进行审查，提出处理意见。
4. 告知：作出行政处罚决定前，应制作《行政处罚告知书》送达当事人，告知违法事实及其享有的陈述、申辩等权利。
5. 送达：行政处罚决定书应当在宣告后当场交付当事人；当事人不在场的，行政机关应当在七日内依照行政诉讼法的有关规定，将行政处罚决定书送达当事人。
6. 执行：依照生效的行政处罚决定，自觉履行或强制执行。

三. 总结

侵占、破坏种质资源是违法行为，将受到法律的严厉制裁。因此，我建议任何单位和个人都应遵守相关法律法规，保护种质资源，不得进行侵占或破坏。如有进一步需要，您可以继续咨询我。