农机司机造成物损，应当依据《民法典》的相关规定进行赔偿。具体分析如下：

一. 赔偿责任的确定

1. 一般原则：根据《民法典》第一千一百六十五条，行为人因过错侵害他人民事权益造成损害的，应当承担侵权责任。农机司机在驾驶过程中，若因过错（如操作不当、疏忽大意等）导致他人财物受损，应当承担相应的赔偿责任。
2. 特殊情形：如果农机司机是在执行工作任务时造成物损，根据《民法典》第一千一百九十一条，用人单位的工作人员因执行工作任务造成他人损害的，由用人单位承担侵权责任。此时，赔偿责任由农机司机的用人单位承担。

二. 赔偿范围的确定 根据《民法典》第一千一百八十四条，侵害他人财产的，财产损失按照损失发生时的市场价格或者其他合理方式计算。因此，农机司机造成物损的赔偿范围应包括受损财物的实际价值，以及可能产生的其他合理费用（如评估费、修复期间的损失等）。

三. 赔偿程序的执行

1. 协商：首先，受损方与农机司机（或其用人单位）应尝试通过协商达成赔偿协议。
2. 诉讼：若协商不成，受损方可以依据《民法典》的相关规定，向人民法院提起诉讼，要求农机司机（或其用人单位）承担赔偿责任。

我建议，在发生物损后，受损方应及时收集证据（如现场照片、视频、证人证言等），以便在协商或诉讼过程中证明自己的损失和农机司机的过错。同时，农机司机也应积极配合调查，主动承担责任，以减少不必要的纠纷。如有进一步需要，您可以继续咨询我。