农民工有扣缴义务人。具体来说：

1. 一般情况：根据税法规定，农民工的工资收入也需要依法缴纳个人所得税。在这种情况下，如果农民工的工资是由单位或企业支付的，那么单位或企业作为支付方，就承担了代扣代缴个人所得税的义务，即成为农民工的扣缴义务人。单位或企业需要在支付工资时，按照税法规定扣除应缴纳的个人所得税，并将税款上缴至税务机关。

2. 特殊情况：如果农民工是以个体工商户、个人独资企业或者合伙企业的形式从事经营活动，并取得收入，那么他们就需要自行申报并缴纳个人所得税，此时他们自身就是纳税义务人，而不是由其他单位或企业代扣代缴。

综上所述，农民工的扣缴义务人主要取决于其工资支付方或经营形式。如果是单位或企业支付工资，则单位或企业为扣缴义务人；如果农民工自行经营并取得收入，则他们自身为纳税义务人。如有更多关于税务或劳动法律方面的问题，欢迎随时向我咨询。