首先，我们需要明确一点：营业执照与营业金额流水的归属权是两个不同的法律问题。营业执照是公司或个体工商户合法经营的凭证，其归属权通常属于公司或个体工商户的法定代表人或经营者。而营业金额流水则是公司或个体工商户在经营过程中产生的收入记录，其归属权可能与营业执照的归属权并不完全一致。
针对您的情况，如果营业执照不是您的，但营业的金额流水在您手里，这在离婚案件中可能会涉及以下几个方面的考量：
财产分割：
- 在离婚案件中，法院会首先对夫妻双方的共同财产进行分割。如果营业金额流水被认定为夫妻共同财产（例如，您与配偶共同经营该业务，或该收入用于家庭共同生活），那么这部分财产将按照法律规定进行分割。
- 如果营业金额流水并非夫妻共同财产，而是您个人通过其他合法途径获得的（例如，您作为公司的员工或合作伙伴，负责公司的财务管理，但并非公司的法定代表人或经营者），那么这部分财产可能不会被纳入离婚财产分割的范围。
证据认定：
- 您手中的营业金额流水将作为重要的证据材料，用于证明您与配偶之间的财产状况以及可能的财产分割方案。
- 法院会对这份证据进行审查，确认其真实性、合法性和关联性，并根据证据情况作出相应的判决。
法律后果：
- 如果营业执照的归属权存在争议，可能会引发另一场法律纠纷。因此，在处理离婚案件时，法院可能会建议双方先解决营业执照的归属问题，再处理离婚财产分割事宜。
- 如果营业金额流水被认定为非法所得或存在其他违法行为，您可能会面临相应的法律责任。
综上所述，法院在判决时会综合考虑营业金额流水的来源、性质以及您与配偶之间的财产状况等因素。因此，我建议您在离婚前与配偶协商处理好财产分割事宜，并尽可能收集相关证据材料以支持您的主张。如果您需要更具体的法律建议或帮助，请随时向我咨询。