公司机密文件和内部文件保密要求的区别主要在于它们的内容性质、保密等级以及相应的管理措施。以下是具体的分析：
内容性质与保密等级：
- 公司机密文件：这类文件通常包含公司的核心商业秘密、技术秘密、客户资料、财务数据等高度敏感信息。这些信息一旦泄露，可能会对公司的竞争力、经济利益甚至生存造成重大损害。因此，公司机密文件的保密等级通常较高，需要采取严格的保密措施。
- 内部文件：内部文件则涵盖了公司日常运营、管理、决策等过程中产生的各类文件，包括会议记录、工作报告、内部通知等。这些文件虽然对公司内部管理和决策有一定价值，但并不一定涉及核心商业秘密或高度敏感信息。因此，内部文件的保密等级相对较低，可能仅需要在公司内部进行有限范围的传阅和保管。
管理措施：
- 公司机密文件：对于公司机密文件，公司通常会制定严格的保密制度和管理措施。例如，限制知悉范围，仅允许特定人员接触和查阅；采取加密存储和传输措施，确保文件在传输过程中不被窃取或篡改；定期对机密文件进行审查和更新，确保信息的准确性和时效性；以及建立严格的保密责任制度，对违反保密规定的行为进行严肃处理。
- 内部文件：对于内部文件，公司也会采取一定的管理措施，但相对于机密文件来说可能更为宽松。例如，内部文件可能仅需要在公司内部进行传阅和保管，而不需要采取加密措施；对于某些重要的内部文件，公司可能会设定一定的知悉范围，但并不一定像机密文件那样严格限制。
综上所述，公司机密文件和内部文件在保密要求上存在明显的区别。公司机密文件因其涉及核心商业秘密和高度敏感信息，需要采取更为严格的保密措施和管理制度；而内部文件则因其内容性质相对较为普通，保密要求相对较低。在实际操作中，公司应根据文件的具体内容和性质，制定相应的保密制度和管理措施，确保文件的安全性和保密性。