安全文明措施费在结算时，经甲乙双方协商一致，是可以进行核减的。以下是对这一问题的详细分析：

1. 合同原则：

   • 根据合同法的基本原则，合同是双方意思表示一致的产物，只要合同内容不违反法律、行政法规的强制性规定，不违背公序良俗，且双方均具备相应的民事行为能力，那么合同就是有效且受法律保护的。
   • 在此基础上，如果甲乙双方在合同中明确约定了安全文明措施费的支付、调整或核减条款，或者在合同执行过程中通过补充协议、会议纪要等形式达成了关于安全文明措施费核减的一致意见，那么这种核减行为就是合法有效的。

2. 实际操作：

   • 在实际操作中，安全文明措施费的核减可能基于多种原因，如工程实际施工情况的变化、双方对费用负担的重新协商等。
   • 核减的具体数额和方式应由双方共同确定，并应明确记载在合同或相关协议中，以确保双方的权益得到保障。

3. 法律后果：

   • 如果双方已经就安全文明措施费的核减达成了一致，并且这种核减行为符合合同法和相关法律法规的规定，那么双方均应按照约定履行各自的义务。
   • 如果一方在核减后反悔或拒绝履行相关义务，那么另一方可以依据合同和相关法律法规追究其违约责任。

综上所述，安全文明措施费在结算时是可以经甲乙双方协商一致进行核减的。但需要注意的是，这种核减行为必须基于双方的真实意思表示，并且应符合合同法和相关法律法规的规定。如有任何疑问或争议，建议及时咨询专业律师以获取更具体的法律建议。