公司律师在特定情况下可以查询本单位案件。具体分析如下：

一. 公司律师的权限

1. 依据与范围：根据《公司律师管理办法》第二条，公司律师是指与国有企业订立劳动合同，依法取得法律执业资格或者律师资格，在企业内部从事法律事务工作的专业人员。他们的工作范围包括为本单位提供法律服务，处理法律事务，这自然可能涉及到对本单位案件的查询。
2. 查询权限：在涉及本单位法律事务的情况下，公司律师有权查询与本单位相关的案件信息，以便更好地提供法律建议和代理服务。

二. 查询本单位案件的具体情形

1. 内部法律事务处理：当公司面临法律纠纷或需要法律咨询时，公司律师需要了解案件的具体情况，以便为公司提供合适的法律建议。这时，查询本单位案件是必要的。
2. 代理诉讼或仲裁：如果公司委托公司律师代理诉讼或仲裁案件，律师需要详细了解案件的历史和现状，以便在诉讼或仲裁过程中为公司争取最大利益。这也需要查询本单位案件。

三. 查询的合法性与合规性

1. 遵守法律法规：公司律师在查询本单位案件时，必须遵守相关法律法规和职业道德规范，确保查询行为的合法性和合规性。
2. 保护商业秘密与隐私：在查询过程中，公司律师应注意保护公司的商业秘密和个人的隐私权，避免泄露敏感信息。

我的观点：综上所述，公司律师在特定情况下，如处理内部法律事务或代理诉讼、仲裁案件时，有权查询本单位案件。但查询行为必须遵守相关法律法规和职业道德规范，确保合法性和合规性。如有进一步需要，您可以继续咨询我。