民办学校未按规定提取资助经费，应由县级以上人民政府教育行政部门、人力资源社会保障行政部门或者其他有关部门进行处罚，具体处罚措施包括责令限期改正、警告、没收违法所得、责令停止招生、吊销办学许可证以及追究刑事责任等。
一. 处罚主体与法律依据
- 处罚主体：根据《中华人民共和国民办教育促进法》及其实施条例，对民办学校未按规定提取资助经费的行为，由县级以上人民政府教育行政部门、人力资源社会保障行政部门或者其他有关部门依据职责分工进行处罚。
- 法律依据：
- 《中华人民共和国民办教育促进法》第六十二条规定了民办学校一系列违法行为的处罚措施，虽然未直接提及未按规定提取资助经费，但“恶意终止办学、抽逃资金或者挪用办学经费”等类似行为均受到严厉处罚，未按规定提取资助经费同样属于违反教育经费管理规定的行为，应受相应处罚。
- 《中华人民共和国民办教育促进法实施条例》也进一步明确了民办学校举办者及实际控制人、决策机构或者监督机构组成人员未按时、足额履行出资义务或挪用办学经费等行为的处罚措施。
二. 处罚措施
- 责令限期改正：首先，相关部门会责令民办学校限期改正其未按规定提取资助经费的行为。
- 警告与没收违法所得：若民办学校逾期未改正，相关部门将对其予以警告，并有违法所得的，退还所收费用后没收违法所得。
- 责令停止招生与吊销办学许可证：对于情节严重的民办学校，相关部门将责令其停止招生，甚至吊销办学许可证。
- 追究刑事责任：若民办学校的行为构成犯罪，将依法追究其刑事责任。
三. 实际执行流程
- 相关部门在发现或接到举报后，会进行审查并决定是否立案。
- 立案后，组织调查取证，确保事实清楚、证据确凿。
- 根据调查结果，提出处理意见，并告知当事人处罚的事实、理由和依据及其依法享有的陈述、申辩等权利。
- 制作行政处罚决定书，并按法律规定的方式送达当事人。
- 监督实施情况，确保处罚措施得到有效执行。
综上所述，民办学校未按规定提取资助经费将面临严格的处罚措施，包括责令限期改正、警告、没收违法所得、责令停止招生、吊销办学许可证以及追究刑事责任等。我建议民办学校应严格遵守相关法律法规，确保教育经费的合理使用和管理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。