行政机关可以作为民事诉讼的被告。根据我国《中华人民共和国民事诉讼法》第四十八条的规定，公民、法人和其他组织都可以作为民事诉讼的当事人，这里所提到的“其他组织”事实上涵盖了行政机关在内。在某些特定的情境下，行政部门的角色通常会与民事主体产生交集和重叠，此时行政机关可以作为普通的民事主体参与民事诉讼。

例如，如果政府机关需要进行内部装修，与装修施工方签订了合同，那么在合同履行过程中如果出现纠纷，行政机关就可以作为民事诉讼的一方当事人，参与诉讼过程。

因此，当行政机关作为民事诉讼的被告时，其参与诉讼的程序与其他民事主体相同，需要按照民事诉讼法的规定进行答辩、举证等诉讼活动。如果你在这方面有具体的法律问题，可以直接向我咨询，我会为你提供专业的法律帮助。