申请行政复议的原因，即公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯了其合法权益。这些原因具体可以归纳为以下几个方面：
具体行政行为认定事实不清：
- 证据不足：行政机关作出决定时所依据的证据不充分，无法确凿证明所认定的事实。
- 事实认定错误：行政机关对关键事实的理解和判断出现偏差，导致错误决定。
具体行政行为适用法律错误：
- 适用法律条款错误：行政机关引用了已废止或不适用的法律条文作出决定。
- 法律解释错误：行政机关对法律的理解和解释偏离了本意。
具体行政行为违反法定程序：
- 未履行告知义务：行政机关在作出影响相对人权益的决定前，未按法律规定告知相关事项。
- 违反时限规定：行政机关未在法定期限内完成行政程序。
- 剥夺陈述、申辩权：行政机关未给予当事人充分的陈述和申辩机会。
具体行政行为超越职权或滥用职权：
- 超越职权：行政机关行使了不属于其法定权限内的权力。
- 滥用职权：行政机关虽在其权限内作出行为，但不合理地行使了权力。
具体行政行为明显不当：
- 处罚畸轻畸重：行政处罚与违法行为的事实、性质、情节及社会危害程度不相适应。
- 不合理的差别对待：行政机关在处理类似情况时未遵循公平原则。
此外，还有一些其他常见的复议情形，如：
- 对行政处罚决定不服，包括警告、罚款、没收违法所得等。
- 对行政强制措施决定不服，如限制人身自由、查封、扣押、冻结财产等。
- 对行政许可决定不满，涉及许可证、执照、资质证等证书的变更、中止、撤销决定。
- 对自然资源权利的决定不服，如土地、矿藏等自然资源的所有权或使用权的决定。
- 认为行政机关行为侵犯了合法的经营自主权。
- 农业承包合同争议，认为行政机关变更或废止农业承包合同，侵犯了合法权益。
- 行政机关违法要求履行义务，如违法集资、征收财物、摊派费用等。
- 符合法定条件但行政机关未依法颁发证书或审批登记。
- 行政机关未依法履行保护人身权利、财产权利等法定职责。
- 行政机关未依法发放抚恤金、社会保险金或最低生活保障费。
综上所述，当公民、法人或其他组织认为行政机关的具体行政行为侵犯了其合法权益时，可以依法申请行政复议，以维护自身的合法权益。在申请行政复议时，应明确表达不满的情形，并附上相关证据以支持复议请求。