微粒贷逾期可能会从经营账户里扣款，但具体情况需根据借款合同和实际情况来判断。

1. 合同约定：首先，微粒贷作为一款借贷产品，其扣款行为主要依据的是与用户签订的借款合同。合同中通常会明确约定还款方式、还款账户以及逾期后的处理方式。如果合同中明确规定了可以从经营账户扣款，那么逾期后，微粒贷确实有权从该账户中划扣资金以偿还逾期款项。

2. 实际情况：其次，即使合同中没有明确规定，但在实际操作中，微粒贷也可能会根据用户的还款情况和账户情况，选择从经营账户或其他关联账户中扣款。这通常发生在用户逾期时间较长，且微粒贷通过多种方式均无法联系到用户或用户未主动还款的情况下。

3. 法律限制：然而，需要注意的是，微粒贷的扣款行为也受到法律的限制。例如，扣款金额不能超过用户应还的逾期款项，且不能违反相关法律法规关于资金扣划的规定。此外，如果扣款行为导致用户经营账户资金短缺，影响用户正常经营，用户也有权通过法律途径维护自己的合法权益。

综上所述，微粒贷逾期是否会从经营账户里扣款，取决于借款合同的具体约定以及实际情况。建议您仔细查阅借款合同中的相关条款，并密切关注自己的账户动态。如有任何疑问或需要帮助，请直接向我咨询。