三方实习协议，也称为《全国普通高等学校毕业生就业协议书》，确实具有法律效力。这是一份由毕业生、用人单位和学校三方共同签署的协议，一式三份，各方各持一份。它主要作用于毕业生与用人单位达成就业意向后，作为学校为毕业生进行派遣的依据。

从法律性质上看，三方协议属于民事合同范畴，是毕业生与用人单位在正式确立劳动人事关系前，就双方达成就业意向、明确在就业过程中的权利和义务而达成的书面协议。这份协议是用人单位确认毕业生相关信息真实可靠以及同意接收毕业生的重要凭据，同时也是高校进行毕业生就业管理、编制就业方案以及毕业生办理就业落户手续等有关事项的重要依据。

三方协议的效力始于签订之时，终于毕业生到单位报到、正式签订劳动合同之后。在协议有效期内，如果任何一方违反协议约定，都可能需要承担相应的违约责任，包括支付违约金等。当然，具体的违约责任和违约金数额，需要在协议中明确约定。

需要注意的是，三方协议虽然具有法律效力，但它并不等同于正式的劳动合同。毕业生在正式入职后，还需要与用人单位签订正式的劳动合同，以进一步明确双方的权利和义务。同时，在签订三方协议时，毕业生应当仔细阅读协议条款，确保自己充分了解并同意协议内容，避免因为盲目签订而带来不必要的麻烦。