当公司股东全部退休时，他们需要处理的主要是股东身份、股权管理以及可能的公司职务变动等方面的问题。以下是根据相关法律法规和公司运营常识，为您提供的详细解答：
一、股东身份的保留与权益
股东身份不受退休影响：
- 股东的身份是基于对公司的出资而获得的，与退休年龄无直接关联。即使股东退休，他们仍然可以保留股东身份，并继续享有资产收益、参与重大决策和选择管理者等权利。
继续享有股东权益：
- 退休后的股东仍然有权按照公司章程和相关法律法规获取股权收益，如分红、股权增值等。
二、股权管理与处理
继续持有股权：
- 股东可以选择继续持有公司股权，不参与公司的日常经营，但享受股权带来的收益。
股权转让：
- 内部转让：股东可以将股权转让给公司内的其他股东，这通常涉及签订股权转让协议，并办理相应的工商变更登记手续。
- 外部转让：股东也可以将股权转让给公司外的第三方，但这需要遵循一定的程序，包括征得其他股东过半数的同意，并可能涉及书面通知、征求同意等步骤。
股权继承安排：
- 股东应考虑股权的继承问题，可以在公司章程中明确股权继承的条款，或者与家人协商安排好继承事宜。
三、公司职务的变动
- 特定职务的退休：
- 如果股东在公司中担任特定的职务（如董事、监事等），并且这些职务有明确的年龄限制或退休规定，那么他们可能需要在达到退休年龄后辞去这些职务。
- 辞去特定职务并不影响股东的身份和权益，他们仍然可以作为股东参与公司的重大决策和享受股权收益。
四、遵循公司章程与特殊协议
公司章程的约束力：
- 公司章程对公司、股东、董事、监事、高级管理人员具有法律约束力。如果公司章程对股东退休后的股权处理等有特殊规定，股东和公司均需遵守。
特殊协议的履行：
- 如果股东之间存在一致行动人协议、股权回购协议等特殊协议，股东在退休后需要按照协议的约定履行相应的义务。
综上所述，公司股东全部退休后，他们的股东身份和股权不受直接影响。股东可以根据自身情况和意愿，选择继续持有股权、参与公司经营或者进行股权转让等安排。同时，他们也需要关注公司章程和特殊协议的规定，以及可能的公司职务变动。