针对你提出的问题“农村自建房受损，法院是否可以因不能证明系合法所有权人裁定驳回”，我的回答如下：

结论：法院在审理农村自建房受损案件时，若原告无法证明其系该房屋的合法所有权人，确实可能面临被法院裁定驳回起诉的风险。

分析说明：

1. 诉讼主体资格：在民事诉讼中，原告必须证明其与案件有直接利害关系，即具备诉讼主体资格。对于农村自建房受损案件，原告需证明其是房屋的合法所有权人，才能作为适格原告提起诉讼。

2. 证据要求：法院在审理案件时，会严格审查原告提供的证据。若原告无法提供充分有效的证据证明其系房屋合法所有权人，如房产证、建房许可证、宅基地使用权证等，法院可能会认为原告不具备诉讼主体资格，从而裁定驳回起诉。

3. 法律后果：被法院裁定驳回起诉后，原告将无法通过该诉讼程序维护其权益。此时，原告需要寻找其他途径解决纠纷，如通过协商、调解或另行提起诉讼等。

建议：

• 在提起诉讼前，务必确保已收集并整理好充分有效的证据证明自己的诉讼主体资格。
• 如遇法院裁定驳回起诉，应及时咨询专业律师，了解后续可行的法律途径和解决方案。

综上所述，农村自建房受损案件的原告若无法证明其系合法所有权人，确实可能面临被法院裁定驳回起诉的风险。因此，在提起诉讼前，务必做好充分的证据准备工作。