三岁以下孩子的毛发确实可以用于进行亲子鉴定。不过，需要注意的是，虽然毛发是亲子鉴定的一种样本类型，但在实际操作中，对于三岁以下的孩子，我们通常更推荐使用口腔拭子作为样本，因为这种方法更为简便且对孩子的伤害更小。

详细分析：

1. 样本类型：

   • 毛发：虽然可以作为亲子鉴定的样本，但在采集时需要注意避免污染，且对于三岁以下的孩子来说，采集毛发可能会相对困难，甚至可能对孩子造成一定的不适。
   • 口腔拭子：这是更为常用且简便的样本采集方法，尤其是对于年幼的孩子。通过轻轻擦拭孩子口腔内的颊粘膜，即可获取足够的DNA样本，且对孩子几乎无伤害。

2. 亲子鉴定流程：

   • 样本采集：无论是毛发还是口腔拭子，都需要确保样本的纯净和无污染。
   • 样本送检：将采集到的样本送至专业的亲子鉴定机构进行检测。
   • 结果分析：鉴定机构会根据样本中的DNA信息，通过比对和分析，得出亲子关系的结论。

3. 注意事项：

   • 在进行亲子鉴定前，建议与专业的鉴定机构咨询，了解具体的样本采集要求和鉴定流程。
   • 确保样本的采集和送检过程符合相关规定，以保证鉴定结果的准确性和可靠性。

综上所述，虽然三岁以下孩子的毛发可以用于亲子鉴定，但考虑到孩子的年龄和舒适度，更推荐使用口腔拭子作为样本。如果你有任何关于亲子鉴定的疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。