撞车后当时没事但第二天死亡，且死因不明的情况下，通常需要进行解剖尸检。以下是对此情况的详细分析：

1. 法律程序要求：在交通事故导致人员死亡，尤其是死因不明的情况下，为了明确死亡原因，判断是否与交通事故有直接关系，通常需要进行解剖尸检。这是法律程序的一部分，也是确保公正、准确处理交通事故案件的重要环节。

2. 医学判断需要：解剖尸检可以揭示死者身体内部的损伤情况，包括但不限于内脏破裂、脑出血等，这些损伤可能在外表上看不出来，但却是导致死亡的直接原因。通过尸检，医学专家可以更准确地判断死亡原因，为后续的法律程序提供科学依据。

3. 家属权益保障：对于死者家属来说，了解亲人死亡的真正原因是非常重要的。解剖尸检可以帮助家属获得这一关键信息，从而为他们争取应有的权益提供有力支持。

4. 排除其他因素：在某些情况下，死亡可能并非完全由交通事故导致，而是与其他疾病或因素有关。通过解剖尸检，可以排除这些其他因素，确保交通事故处理的准确性和公正性。

综上所述，撞车后当时没事但第二天死亡，且死因不明的情况下，进行解剖尸检是非常必要的。这不仅有助于明确死亡原因，判断与交通事故的关系，还能为家属提供法律依据，确保交通事故处理的公正性和准确性。如果你或你的家人遇到类似情况，建议及时联系相关部门，并咨询专业律师以获取更详细的法律建议。