高标准农田施工纠纷的认定主要依据合同条款、相关法律法规及行业标准，其法律效力来源于法律法规及合同条款的约定。具体分析如下：

一. 认定依据

1. 合同条款：高标准农田施工合同是纠纷认定的首要依据。合同中应明确工程范围、质量标准、工期、价款、违约责任等关键条款。当发生纠纷时，首先应依据合同条款判断各方责任及违约情况。

   • 例如，若合同中约定了具体的施工标准和验收流程，而实际施工未达到这些标准，则构成违约，可依据合同条款追究责任。

2. 相关法律法规：如《中华人民共和国建筑法》、《中华人民共和国合同法》等，为高标准农田施工纠纷提供了法律框架和认定标准。这些法律法规规定了施工合同的签订、履行、变更、解除等法律行为，以及施工过程中的质量、安全、进度等管理要求。

   • 例如，《中华人民共和国合同法》规定了合同的效力、履行、违约责任等，为纠纷处理提供了法律依据。

3. 行业标准：高标准农田建设涉及农业、水利、土建等多个领域，相关行业标准也是纠纷认定的重要依据。如农田建设标准、水利工程施工规范等，这些标准规定了施工的具体技术要求和操作方法。

   • 例如，若施工中未按照水利工程施工规范进行，导致工程出现质量问题，则可依据该规范认定施工方的责任。

二. 法律效力

1. 合同条款的法律效力：依法成立的合同，对当事人具有法律约束力。当事人应当按照约定履行自己的义务，不得擅自变更或者解除合同。当发生纠纷时，合同条款是判断各方责任及违约情况的重要依据，具有法律效力。

2. 法律法规的法律效力：法律法规是由国家制定或认可并具有国家强制力的社会规范。在高标准农田施工纠纷中，相关法律法规为纠纷处理提供了法律框架和认定标准，具有最高的法律效力。

3. 行业标准的法律效力：虽然行业标准本身不具有直接的法律效力，但它是判断施工行为是否符合行业要求的重要依据。在纠纷处理中，若施工行为违反了行业标准，通常会被视为违约或违法行为，从而承担相应的法律责任。

我建议，在处理高标准农田施工纠纷时，应首先依据合同条款判断各方责任；若合同条款不明确或存在争议，则应参考相关法律法规及行业标准进行认定。同时，为确保纠纷处理的公正性和合法性，建议寻求专业律师的协助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。