可以起诉被删除的公众号文章。以下是对此问题的详细分析：
一. 起诉被删除公众号文章的法律依据
《中华人民共和国著作权法》第二条规定：中国公民、法人或者其他组织的作品，不论是否发表，依照本法享有著作权。著作权包括发表权、署名权、修改权、保护作品完整权、复制权、发行权、信息网络传播权等。因此，即使公众号文章被删除，文章的著作权人仍然享有上述权利。
《中华人民共和国侵权责任法》第三条规定：被侵权人有权请求侵权人承担侵权责任。如果公众号文章被删除，且删除行为构成对著作权人权利的侵犯，那么著作权人有权依法提起诉讼，要求侵权人承担相应的法律责任。
二. 起诉被删除公众号文章的实践操作
收集并保留相关证据：在文章被删除后，应尽快收集并保留相关证据，如文章截图、存档等，以证明文章存在过并被删除的事实。这些证据将在诉讼过程中起到关键作用。
明确起诉条件和要求：起诉必须符合《中华人民共和国民事诉讼法》规定的起诉条件，包括原告与本案有直接利害关系、有明确的被告、有具体的诉讼请求和事实理由、属于人民法院受理民事诉讼的范围和受诉人民法院管辖。
提交起诉状和相关材料：在准备好起诉状和相关证据材料后，可以向有管辖权的人民法院提交起诉状和证据材料，正式提起诉讼。
三. 关于“通知-取下规则”的说明
《侵权责任法》第36条项下所规定的「通知-取下规则」：网络服务提供者接到被侵权人通知后，应及时采取删除、屏蔽、断开链接等必要措施。如果网络服务提供者未及时采取必要措施，对损害的扩大部分与该网络用户承担连带责任。
关于“反通知”制度：虽然我国《侵权责任法》没有明确规定“反通知”制度，但理论上著作权人可以在证明自己的行为并非侵权行为后，要求网络服务提供者恢复被删除的文章。然而，这需要在具体的法律实践中进行探索和争取。
四. 我的建议
评估诉讼风险和成本：在决定起诉前，应充分考虑诉讼的风险和成本，包括时间成本、金钱成本以及可能面临的败诉风险等。
寻求专业法律帮助：由于此类案件涉及复杂的法律问题和实践操作，我建议您在决定起诉前咨询专业的律师或法律机构，以获取更准确的法律意见和帮助。
综上所述，被删除的公众号文章是可以起诉的，但具体是否起诉以及如何起诉需要根据实际情况进行综合考虑。如有进一步需要，您可以继续咨询我。