可以，合同名称最后为“某某协议一式两份”是可行的。这里我们从几个方面来详细解释：

1. 合同与协议的区别与联系：

   • 在法律上，“合同”和“协议”并没有严格的区分，它们都是当事人之间设立、变更、终止民事关系的协议。因此，合同可以称为协议，协议也可以称为合同。
   • 无论是称为“合同”还是“协议”，关键是要看其内容是否明确、合法，以及双方当事人的意思表示是否真实。

2. 合同名称的灵活性：

   • 合同的名称并不是决定其法律性质的关键因素，而是合同的内容决定了其法律性质。
   • 因此，合同名称最后为“某某协议”并不会影响合同的法律效力，只要合同内容符合法律法规的规定，双方当事人的意思表示真实，那么这份合同就是有效的。

3. 一式两份的要求：

   • “一式两份”通常指的是合同文本的数量，即双方各持一份，以便于双方查阅和履行。
   • 这并不与合同的名称直接相关，而是与合同的签订和履行方式有关。无论合同名称如何，只要双方同意一式两份，且合同内容明确、合法，那么这份合同就是有效的。

综上所述，合同名称最后为“某某协议一式两份”是可以的，这并不会影响合同的法律效力和双方当事人的权利义务。如果你还有其他关于合同的问题，或者需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。