非法经营司机运输烟并不一定会被判刑，具体是否判刑以及判刑的轻重取决于多个因素，包括司机的知情程度、犯罪情节、涉案金额以及是否构成相关犯罪等。

1. 知情程度与法律责任：

   • 若司机明知所运输的是假烟或未经烟草专卖行政主管部门许可的烟草制品，且没有准运证等相关许可证明文件，其运输行为将可能构成非法经营罪或生产、销售伪劣产品罪的共犯。在这种情况下，司机将承担相应的法律责任，可能面临有期徒刑、罚金等刑罚。
   • 若司机能够证明自己确实不知道运输的是假烟或未经许可的烟草制品，且没有故意为之的意图，那么通常不会构成犯罪，但也可能因违反相关行政法规而受到行政处罚。

2. 犯罪情节与涉案金额：

   • 非法经营罪或生产、销售伪劣产品罪的刑罚轻重，往往与犯罪情节和涉案金额密切相关。涉案金额越大，犯罪情节越严重，刑罚也就越重。
   • 在司法实践中，法院会根据具体案情，如运输的烟草制品数量、价值、运输方式、犯罪动机等，来综合判断犯罪情节和涉案金额的严重程度，并据此作出相应的判决。

3. 法律建议：

   • 为避免不必要的法律风险，司机在接受运输任务时，应充分了解所运货物的性质并确保其合法性。
   • 司机应保持警惕，避免被不法分子利用而卷入违法犯罪活动。若发现自己可能涉及运输假烟等违法行为，应及时向相关部门举报并配合调查。
   • 若司机面临相关法律问题或疑虑，应及时咨询专业律师，以获取准确的法律意见和帮助。

综上所述，非法经营司机运输烟并不一定会被判刑，具体结果取决于多个因素。司机应严格遵守法律法规，确保所运货物的合法性与安全性，以避免不必要的法律风险。