针对农用船非法载人的问题，这是一项严重的违法行为，不仅可能危及公共安全，还会对正常的渔业生产秩序或水上交通秩序造成不良影响。以下是对此行为可能面临的处罚措施的详细解答：

一、法律依据

处理农用船非法载人行为主要依据的法律法规有《中华人民共和国渔业法》、《中华人民共和国内河交通安全管理条例》、《中华人民共和国渔业船员管理办法》以及地方的相关水上交通安全法规等。这些法律法规为打击此类违法行为提供了明确的法律基础。

二、处罚措施

1. 警告与责令改正：

   • 对于初次违法、情节较轻且未造成严重后果的，相关部门将给予警告处罚，并责令立即停止违规行为，同时要求采取措施确保船只安全航行。

2. 罚款：

   • 罚款额度根据不同法规和地方裁量基准有所不同。一般情况下，可处1000元以上1万元以下罚款。例如，根据《中华人民共和国渔业船员管理办法》，渔业船员违反规定利用渔业船舶私载人员的，可处在此范围内的罚款。
   • 在某些地区，如浙江省，根据地方规定，罚款金额可能更高，甚至达到数万元。
   • 若因农用船非法载人导致水上交通安全事故，造成人员伤亡或重大财产损失，罚款金额会大幅提高，最高可达数十万元。

3. 暂扣或吊销相关证件：

   • 渔政部门和海事部门有权暂扣或吊销农用船的相关证件，包括渔业捕捞许可证、船舶检验证书、船员适任证书等。这将使农用船暂时或永久失去合法作业和航行资格。
   • 情节严重的违规载人行为，可能会被吊销相关证件6个月至12个月，甚至永久性吊销。

4. 拘留与刑事责任：

   • 如果非法载人行为严重危害公共安全，构成犯罪的，依据《中华人民共和国刑法》，相关责任人可能会被追究刑事责任，面临拘役、有期徒刑等刑罚。
   • 如非法从事经营性旅客运输，严重扰乱运输市场秩序，情节严重的，可能构成非法经营罪；若因非法载人导致人员伤亡，可能涉及交通肇事罪等。

三、民事赔偿责任

除上述行政处罚和刑事处罚外，如果农用船非法载人行为造成了损害，相关部门还可能要求船主对乘客的人身伤害、财产损失等进行赔偿。

四、实际案例

多地已发生多起农用船或渔船违规载人的案例，并均受到了相应的处罚。例如，在广西横州市，一艘渔船因私载乘客被罚款1000元；在浙江舟山，一艘渔船因多次违章搭客被罚款20000元。这些案例起到了警示作用，提醒农用船所有者和船长应严格遵守相关法律法规，不得违规载人。

综上所述，农用船非法载人将面临严厉的处罚措施。为了保障公共安全和维护正常的渔业生产或水上交通秩序，建议农用船所有者和船长加强法律意识，严格遵守相关法律法规，确保船只的安全航行。