行政案件的实体问题主要涉及对具体行政行为合法性的审查，包括以下几个方面：
行政处罚的合法性：
- 行政处罚是行政机关对违反行政管理秩序的行为所实施的一种惩戒措施。在行政案件中，法院会审查行政处罚决定是否合法，包括处罚的种类、幅度、程序等是否符合《中华人民共和国行政处罚法》的相关规定。例如，行政处罚的种类包括警告、通报批评；罚款、没收违法所得、没收非法财物；暂扣许可证件、降低资质等级、吊销许可证件；限制开展生产经营活动、责令停产停业、责令关闭、限制从业；行政拘留等。
行政强制措施的合法性：
- 行政强制措施是行政机关在行政管理过程中，为制止违法行为、防止证据损毁等而采取的临时性措施。法院会审查这些措施的采取是否合法，包括措施的种类、适用条件、程序等是否符合相关法律法规的规定。
行政许可的合法性：
- 行政许可是行政机关根据申请，经依法审查后准予申请人从事特定活动的行为。在行政案件中，法院会审查行政许可的决定、程序、条件等是否符合相关法律法规的规定，以及是否侵犯了申请人的合法权益。
行政征收、征用的合法性：
- 行政征收、征用是行政机关为了公共利益的需要，依法对公民、法人或其他组织的财产进行征收或征用的行为。法院在行政案件中会审查这些行为是否合法，包括征收、征用的目的、程序、补偿等是否符合相关法律法规的规定。
行政合同的履行与争议：
- 行政合同是行政机关与公民、法人或其他组织之间，为实现行政管理目标而签订的合同。在行政案件中，法院会审查行政合同的签订、履行、变更、解除等是否合法，以及是否违反了相关法律法规或合同约定。
综上所述，行政案件的实体问题主要集中在行政处罚、行政强制措施、行政许可、行政征收征用以及行政合同的履行与争议等方面。这些问题都涉及到行政机关的具体行政行为是否合法、合规，以及是否侵犯了公民、法人或其他组织的合法权益。如果您在这些方面有任何法律问题或疑问，都可以直接向我咨询，我擅长处理婚姻家庭、合同纠纷、行政纠纷以及刑事辩护等领域的法律问题。