设立分公司与高新认定无关，分公司不能单独申请高新技术企业认定。具体分析如下：

一. 子公司与分公司的区别

1. 子公司：具有法人资格，可以独立承担民事责任。从法律层面看，子公司是具备独立法人的独立企业。由于具有独立法人资格且在内地注册满1年以上的公司可以申请高新技术企业认定，因此子公司可以申请。

2. 分公司：是总公司下属的直接从事业务经营活动的分支机构或附属机构。分公司不具有企业法人资格，不具有独立的法律地位，不独立承担民事责任。因此，根据高新技术企业认定条件，分公司即使经营满1年也不能申请高新技术企业认定。

二. 结论

由于分公司不具有独立法人资格，不符合高新技术企业认定的条件，因此设立分公司与高新认定无关，分公司不能单独申请高新技术企业认定。

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