事业单位干部经商办企业主要违反了以下规定：
《中国共产党纪律处分条例》：
- 该条例第一百零三条、第一百零八条对违规从事营利活动行为列出了负面清单，并作出了处分规定。其中明确指出，违反有关规定经商办企业，拥有非上市公司（企业）的股份或者证券，在国（境）外注册公司或者投资入股的，将给予相应处分。
《事业单位工作人员处分暂行规定》：
- 该规定也明确禁止事业单位工作人员从事营利性活动或兼职取酬等行为。如果事业单位工作人员经商办企业，将违反这一规定，并可能面临相应的纪律处分。
此外，从职业道德和行为规范的角度来看，事业单位干部经商办企业还可能产生以下不良影响：
- 利益冲突：事业单位工作人员承担着公共服务职责，必须保持中立和公正。经商办企业可能会产生利益冲突，损害公共利益和单位形象。
- 影响本职工作：经商办企业需要投入大量的时间和精力，这可能会影响事业单位工作人员的本职工作，导致工作效率低下或服务质量下降。
- 破坏公平竞争环境：如果事业单位工作人员利用职权或职务上的影响为自己的企业谋取私利，将破坏市场的公平竞争环境，损害其他市场主体的合法权益。
因此，事业单位干部应当严格遵守相关规定，不得经商办企业。如果发现有违反规定的行为，应当及时向有关部门报告，并接受相应的调查和处理。