公证机构在查明继承人系养子女时，通常需要告知其养子女身份。以下是对这一问题的详细分析：

法律背景

在婚姻家庭法律关系中，养子女与亲生子女在法律上具有同等的地位，享有同等的权利和义务。公证机构作为专业的法律服务机构，在办理继承等公证事务时，需要严格遵循法律规定，确保公证的准确性和合法性。

告知养子女身份的必要性

1. 法律权益的保护：告知养子女其身份，有助于确保其作为继承人的合法权益得到保护。养子女在继承中享有与亲生子女相同的继承权，这一权益的行使需要建立在对其身份明确认知的基础上。

2. 公证的准确性与公信力：公证机构在办理继承公证时，需要准确查明继承人的身份和继承权。养子女的身份是继承权的重要基础，明确告知有助于提升公证的准确性和公信力。

3. 避免潜在纠纷：在继承过程中，若养子女的身份未得到明确告知，可能会引发潜在的继承纠纷。通过告知养子女身份，可以在一定程度上预防此类纠纷的发生。

告知养子女身份的方式

公证机构在查明继承人系养子女后，可以通过以下方式告知其身份：

• 直接告知：公证机构可以直接向养子女说明其身份，并解释相关法律规定和继承权利。
• 书面通知：公证机构可以向养子女发出书面通知，明确其养子女身份及继承权利。
• 公证文书：在办理继承公证时，公证机构可以在公证文书中明确注明养子女的身份和继承权利。

综上所述，公证机构在查明继承人系养子女时，应当告知其养子女身份。这一做法不仅符合法律规定，也有助于保护养子女的合法权益，提升公证的准确性和公信力，并预防潜在的继承纠纷。