走私动物制品的价值在计算时，通常不会扣除运费。这是因为走私行为本身是非法的，而运费作为走私活动的一部分，也是非法支出的费用。在计算走私物品的价值时，一般会以其在市场上的正常价格或者走私时的交易价格来确定，而不会扣除任何非法活动的成本，包括运费。

从法律的角度来看，走私是一种严重的违法行为，不仅违反了海关法规，还可能涉及到其他相关的法律法规。在走私案件中，对于走私物品的价值认定，是定罪量刑的重要依据之一。因此，在计算走私动物制品的价值时，应当严格按照法律规定进行，不会扣除运费等非法成本。

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