部队保障部在特定情况下是可以提起行政诉讼的。具体分析如下：

首先，我们需要明确部队保障部的性质。部队保障部作为部队的一部分，在履行其职责时，可能会与公民、法人或其他组织发生行政争议。当这些争议涉及到部队保障部的具体行政行为，且该行为被认为侵犯了相对人的合法权益时，相对人有权依法向人民法院提起行政诉讼。

其次，从法律角度来看，行政诉讼是公民、法人或其他组织维护自身合法权益的一种重要途径。在行政诉讼中，人民法院会对被诉的具体行政行为进行审查，并作出裁判，从而解决行政争议。因此，部队保障部作为行政主体的一方，在符合法定条件的情况下，是可以成为行政诉讼的被告的。

当然，部队保障部提起行政诉讼或成为行政诉讼的被告，都需要遵循法定的程序和要求。这包括但不限于提起诉讼的主体资格、诉讼的时效、证据的提交等。只有确保这些程序和要求得到严格遵守，才能确保司法公正和行政行为的合法性。

综上所述，部队保障部在特定情况下是可以提起行政诉讼的，但这也需要遵循法定的程序和要求。如果你在这方面有具体的法律问题或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。