标书合同通常是由公司签的，但具体还需要根据实际的招投标情况和合同约定来确定。以下是对这一问题的详细分析：

1. 一般情况：

   • 在招投标过程中，标书合同通常是由招标人与中标人签订的。中标人可以是公司，也可以是其他符合招标要求的组织或个人。因此，在大多数情况下，标书合同是由公司（作为中标人）与招标人签订的。

2. 特殊情况：

   • 如果中标人是一个联合体，那么标书合同可能会由联合体中的各个成员共同与招标人签订，或者由联合体指定的代表与招标人签订。
   • 在某些特定情况下，如政府采购项目，可能会涉及更复杂的合同签订流程，包括与政府部门、代理机构等多方的合同关系。

3. 法律依据：

   • 根据《中华人民共和国招标投标法》及相关实施办法的规定，招标人和中标人应当自中标通知书发出之日起一定期限内（通常为30日），按照招标文件和中标人的投标文件订立书面合同。这进一步确认了标书合同通常是由招标人与中标人（可能是公司）签订的。

4. 注意事项：

   • 在签订标书合同时，应确保合同内容符合招标文件和中标人的投标文件的要求，避免背离合同实质性内容的其他协议。
   • 如果对合同签订主体或流程有任何疑问，建议咨询专业的法律人士或机构，以确保合同的合法性和有效性。

综上所述，标书合同通常是由公司（作为中标人）签订的，但具体还需根据实际的招投标情况和合同约定来确定。如果你在这方面有任何疑问或需要进一步的法律帮助，请随时向我咨询。