关于“淘宝调档是否合法”的问题，这主要涉及到对淘宝平台上的某些行为，如调取或查看交易档案、用户信息等操作的法律合规性。首先，我们需要明确的是，任何涉及用户信息、交易数据等敏感资料的处理，都必须严格遵守相关法律法规，确保用户隐私和数据安全。

从您提供的参考信息来看，市场监管总局和国家档案局联合出台的《经营主体登记档案管理办法》主要规范了经营主体登记档案的管理，包括档案的收集、保管、迁移、查询与利用等方面，并明确了相应的法律责任。这一办法旨在加强经营主体登记档案的规范化管理，有效保护和利用登记档案，便利经营主体跨区域迁移。然而，该办法并未直接涉及电商平台如淘宝的调档行为。

对于淘宝等电商平台而言，其调档行为（如查看、调取用户交易记录、个人信息等）的合法性主要取决于其是否获得了用户的明确授权，以及是否遵守了相关法律法规关于个人信息保护和数据安全的规定。如果淘宝平台在没有用户授权或违反相关法律法规的情况下进行调档操作，那么这种行为可能是不合法的。

此外，还需要注意的是，即使淘宝平台获得了用户的授权，其在处理用户信息时也必须严格遵守相关法律法规的要求，确保信息的安全和保密。如果淘宝平台在处理用户信息过程中存在泄露、滥用等行为，那么也可能面临法律责任。

综上所述，淘宝调档的合法性取决于其是否获得了用户的明确授权，以及是否遵守了相关法律法规关于个人信息保护和数据安全的规定。因此，在进行任何涉及用户信息的操作时，淘宝平台都必须谨慎行事，确保行为的合法性和合规性。同时，用户也应该注意保护自己的个人信息和隐私安全，避免不必要的风险。