非法占用房屋使用费需要交税。具体分析如下：

一. 非法占用房屋使用费的性质

1. 属于应税行为：根据税收相关法律法规，任何经济行为，只要产生了收入，且该收入不属于免税范围，都应依法纳税。非法占用房屋使用费，作为房屋使用者因使用房屋而支付的费用，实质上是一种经济收入，因此属于应税行为。
2. 与合法性无关：税收的征收并不取决于经济行为的合法性。即使非法占用房屋是违法的，但因此产生的使用费收入仍然需要依法纳税。

二. 相关税种及规定

1. 增值税：如果非法占用房屋的使用费属于提供应税劳务或服务，且不属于免税范围，那么应缴纳增值税。具体税率和计税方法需根据当地税收法规确定。
2. 所得税：对于非法占用房屋的使用费收入，如果是企业或个人所得，还应依法缴纳企业所得税或个人所得税。所得税的税率和计税方法同样需根据当地税收法规确定。
3. 其他税种：根据具体情况，可能还需缴纳其他相关税种，如城市维护建设税、教育费附加等。

三. 实际操作建议

1. 咨询税务机关：由于税收法规的复杂性和地域性差异，建议在实际操作中咨询当地税务机关，以明确具体的纳税义务和税率。
2. 依法纳税：无论经济行为是否合法，都应依法履行纳税义务。非法占用房屋虽然违法，但使用费收入仍需依法纳税。

我建议您在实际操作中严格遵守税收法规，确保依法纳税。同时，也建议您咨询当地税务机关以获取更具体的指导和帮助。如有进一步需要，您可以继续咨询我。