没有资质生产酸奶，将由县级以上人民政府市场监督管理部门责令限期补办登记证，逾期不补办的，没收违法所得和违法生产经营的食品，并处一千元以上五千元以下罚款。

一. 法律依据

• 《新疆维吾尔自治区食品小作坊、小餐饮店、小食杂店和食品摊贩管理条例》第十三条第一款规定：“食品小作坊、小餐饮店、小食杂店实行登记管理，登记证应当载明经营者姓名、商号名称、地址、经营项目、投诉举报电话等信息，登记证有效期为三年。”
• 同条例第四十二条第一款规定：“违反本条例第十三条第一款规定，食品小作坊、小餐饮店、小食杂店未取得登记证从事生产经营活动的，由县级以上人民政府市场监督管理部门责令限期补办，逾期不补办的，没收违法所得和违法生产经营的食品，并处一千元以上五千元以下罚款。”

二. 具体情况分析

• 以库车市某加工店为例，该店在未依法取得食品小作坊登记证的情况下，擅自从事酸奶生产销售活动。在被市场监督管理部门发现并责令改正后，仍未在规定时间内取得登记证并继续从事违法生产经营活动。
• 根据上述法律规定，该行为属于未取得食品小作坊登记证从事食品生产经营活动的违法行为，因此，市场监督管理部门有权对其进行处罚。

三. 处罚措施

• 责令限期补办登记证：首先，市场监督管理部门会责令违法者限期补办食品小作坊登记证。
• 逾期不补办的处罚：如果违法者逾期不补办登记证，市场监督管理部门将没收其违法所得和违法生产经营的食品，并处以一千元以上五千元以下的罚款。

综上所述，没有资质生产酸奶将面临严格的法律处罚，包括责令限期补办登记证、没收违法所得和违法生产经营的食品以及罚款等。因此，建议从事食品生产经营活动的个人或企业，务必依法取得相应的资质和许可证，以避免不必要的法律风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。