诊断书上的休息时间规定确实有文件依据。以下是具体的分析：
一. 法规依据
《中华人民共和国劳动法》相关规定：虽然《劳动法》中并未直接规定诊断书上的休息时间，但它强调了劳动者享有休息的权利，以及因健康原因需要休息时，用人单位应给予相应的安排。这为诊断书上休息时间的合理性提供了法律基础。
《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》：此规定明确了职工因患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期。这一规定间接支持了诊断书上关于休息时间的安排，即医生可根据患者的实际情况，在诊断书上建议相应的休息时间。
《工伤保险条例》：对于因工作遭受事故伤害或者患职业病的职工，需要暂停工作接受工伤医疗的，在停工留薪期内，原工资福利待遇不变，由所在单位按月支付。这也体现了诊断书上休息时间的重要性，以及其与职工权益的紧密联系。
二. 实际应用
在实际操作中，医生会根据患者的病情、治疗需要以及康复情况，在诊断书上明确注明建议的休息时间。这一时间通常会被用人单位作为安排员工休假、调整工作岗位或支付病假工资的依据。
例如，如果员工因感冒需要休息一周，医生会在诊断书上写明“建议休息一周”。用人单位根据这一建议，会给予员工相应的病假，并按照公司规定支付病假工资。
综上所述，诊断书上的休息时间规定并非凭空而来，而是有明确的法规依据和实际应用场景的。医生在出具诊断书时，会根据患者的实际情况和医疗需要，给出合理的休息时间建议。这一建议不仅关乎患者的健康恢复，也涉及到劳动者的合法权益保护。因此，诊断书上的休息时间规定是具有法律效力和实际意义的。