不会，逾期后朋友用你的身份证办的银行卡不会被扣费，但这种行为涉及严重的法律风险。

首先，从法律角度来看，银行卡是实名制的，意味着银行卡的所有权和使用权归属于身份证上登记的个人。如果你的朋友使用你的身份证办理了银行卡，那么这张银行卡在法律上属于你的财产，你的朋友并无权使用该卡进行任何交易或操作。

关于逾期扣费的问题，通常发生在借款人未能按时偿还贷款或信用卡欠款等情况下。如果这张银行卡并未与任何贷款或信用卡账户关联，或者并未发生任何逾期行为，那么自然不会产生扣费的情况。即使银行卡与某个贷款或信用卡账户关联，也只有在该账户发生逾期且银行有权从该银行卡中扣费的情况下，才会发生扣费行为。而这一过程与你的朋友无关，因为银行卡的所有权和使用权归属于你。

然而，我必须强调的是，允许他人使用自己的身份证办理银行卡是极其危险的行为。这不仅可能涉及身份盗用、金融诈骗等违法行为，还可能导致你个人信用受损、财务损失等严重后果。如果你的朋友确实需要银行卡进行交易或操作，他应该使用自己的身份证去正规银行机构办理。

总之，逾期后朋友用你的身份证办的银行卡不会被扣费，但你应该立即收回该银行卡并报警处理此类违法行为，以保护自己的合法权益不受侵害。如有任何进一步的法律问题或疑虑，请直接向我咨询。