非公开协议转让通常确实是转让方和受让方联合行文。具体来说：

非公开协议转让，作为一种特定的股权转让方式，其过程涉及转让方与受让方之间的直接协商与约定。在这种转让方式中，双方会就股权转让的相关事宜，如转让价格、转让条件、支付方式等，进行详细的沟通与谈判。一旦达成共识，为了明确双方的权利与义务，确保交易的合法性与有效性，转让方与受让方通常会选择联合行文的方式，即共同签署一份股权转让协议。

这份协议不仅是对双方协商结果的书面确认，更是后续办理股权转让手续、完成股权变更登记的重要依据。因此，在非公开协议转让中，联合行文是不可或缺的一环，它既是双方合作意愿的体现，也是保障交易顺利进行的法律保障。

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