在遭遇对方肇事逃逸，且自己动车后才发现的情况下，为有效维护自身权益，你可以按照以下步骤来处理：

一、立即报警并补充说明情况

首先，第一时间拨打122报警电话，详细准确地描述事故发生的时间、具体地点、逃逸车辆可能的特征（如车型、颜色、车牌号的一部分、车辆标识、受损部位及逃逸方向）等信息。同时，向警方说明自己是在动车后才意识到发生了肇事逃逸的情况，并尽可能提供动车前的观察和记忆信息。

二、回到事故现场（如果可能）

如果条件允许且安全，尝试回到事故现场，查看是否还有遗留的证据，如车辆碎片、刹车痕迹等，并进行拍照或录像记录。同时，注意周围是否有监控摄像头，这可能有助于警方后续的调查和取证。

三、寻找目击证人

主动寻找可能的目击者，特别是那些在你动车前就已经在现场的人。记录他们的联系方式，并请他们提供对事故的所见所闻。目击者的陈述对于事故责任的判定和逃逸车辆的追踪至关重要。

四、配合警方调查

当警方联系你时，如实陈述事故发生经过和你动车后才发现的情况。提供你所知道的逃逸车辆和驾驶人的全部信息，以及任何可能与逃逸车辆有关的线索。

五、医疗救治与费用管理

如果你或你的乘客在事故中受伤，应尽快前往医院进行治疗，并配合医生进行各项检查和治疗。同时，妥善保存所有与医疗救治相关的费用票据，作为后续索赔的重要依据。

六、通知保险公司

及时向自己的保险公司报案，告知事故发生情况和你动车后才发现的肇事逃逸情况。根据保险合同的约定，了解赔偿范围和条件，并准备相关证据材料进行索赔。

七、法律途径追究责任

• 民事赔偿：一旦逃逸车辆被查获，可与逃逸方及其保险公司协商赔偿事宜。如果协商不成，你可以向人民法院提起民事诉讼，要求赔偿财产损失、医疗费用等各项经济损失。
• 刑事追究：若逃逸行为构成犯罪，司法机关将依法追究逃逸方的刑事责任。在此过程中，你也可以提起附带民事诉讼，要求民事赔偿。

八、注意事项

• 保持冷静和耐心，不要擅自离开事故现场（如果已离开，则尽量回到现场或保持与警方的联系）。
• 遵守法律法规，不要破坏现场证据或提供虚假信息。
• 保持与警方和保险公司的沟通联系，及时了解事故处理进展和索赔情况。

综上所述，虽然你在动车后才意识到发生了肇事逃逸的情况，但通过立即报警、回到事故现场（如果可能）、寻找目击证人、配合警方调查、医疗救治与费用管理、通知保险公司以及通过法律途径追究责任等步骤，你仍然可以有效地维护自己的权益。