在等红绿灯时，如果车辆停到了非机动车等候区，这通常属于交通违法行为，因为非机动车等候区是专为非机动车如自行车、电动车等设计的等待区域，旨在保障这些车辆的安全与通行顺畅。机动车停入该区域，不仅违反了机动车应按规定车道行驶的基本原则，还可能影响非机动车的正常等待和通行，增加交通拥堵和事故的风险。

对于此类违法行为，根据《中华人民共和国道路交通安全法》的相关规定，驾驶人可能会面临以下处罚：

1. 罚款：依据法律规定，机动车驾驶人若违反道路交通安全法律、法规中关于道路通行规定的，将面临警告或者二十元以上二百元以下的罚款。具体罚款金额可能因地区而异，但通常会在100元到200元之间。

2. 扣分：关于扣分的具体规定，可能因地区和执法实践的不同而有所差异。《道路交通安全违法行为记分管理办法》中对于不按规定车道行驶的行为有记分的规定，但具体扣分情况需根据当地交警的执法实践和具体规定来确定。一般来说，可能会扣1分至3分不等。

此外，如果该行为导致了交通事故、严重的交通拥堵或其他严重后果，驾驶人可能需要承担更严重的法律责任，包括但不限于更高的罚款、更多的扣分，甚至可能被追究刑事责任。

因此，驾驶人在驾驶过程中应严格遵守交通规则，特别是关于车道使用的规定。如果对当地的交通规则有疑问或不确定，建议查阅最新的交通法规或咨询当地的交通管理部门，以确保行车安全并避免不必要的法律后果。