非中标方资料在保存三年后的处理方式需根据具体情况及法律法规要求来决定，但通常不会直接销毁，而是需继续保存或按规定处理。以下是对此问题的详细分析：

一. 法律法规要求

1. 长期保存要求：根据《政府采购法》第四十二条，采购文件的保存期限为从采购结束之日起至少保存十五年。这些采购文件包括投标文件，因此非中标方的投标文件也需受此规定约束，即至少保存十五年。

2. 特定规定：DA/T 28-2018《建设项目档案管理规范》附录表B.1中指出，未中标文件（或作资料保存）的保管期限为10年。这表明，在某些特定领域或情况下，非中标方的资料保存期限可能有具体规定。

二. 实际处理方式

1. 继续保存：鉴于上述法律法规要求，非中标方资料在保存三年后，通常应继续保存至规定的期限，如十五年或十年，具体取决于适用的规定。

2. 特殊情况处理：若因特殊原因（如存储空间有限、资料重要性降低等）需提前处理，应确保符合相关法律法规要求，并可能需获得相关部门的批准或同意。

3. 电子档案处理：若资料以电子形式保存，还需考虑电子档案的管理和保存要求，确保电子档案的完整性和可读性。

三. 综合建议

• 我建议：非中标方资料在保存三年后，应继续按照法律法规要求保存至规定期限。若需提前处理，应确保符合相关规定并获得必要批准。
• 同时：考虑到电子档案的优势，建议招标采购单位逐步转向电子保存方式，以减轻纸质文件保存的负担和风险。

综上所述，非中标方资料在保存三年后的处理方式需严格遵守法律法规要求，并考虑实际情况进行妥善处理。如有进一步需要，您可以继续咨询我。