儿子借母亲5万元，原则上应当打欠条。以下是具体的分析：

1. 法律关系的明确：

   • 欠条作为债权债务关系的书面凭证，能够明确双方之间的借款事实、借款金额、还款期限等关键信息。
   • 即使借款人是儿子的身份，也不应忽视法律关系的严谨性。打欠条有助于避免未来可能出现的纠纷或误解。

2. 家庭关系的特殊性考虑：

   • 虽然儿子与母亲之间存在血缘关系，但在金钱借贷上，仍应遵循基本的法律原则。
   • 打欠条并不意味着对家庭关系的疏远，而是对双方权益的一种保护。

3. 欠条的法律效力：

   • 欠条一旦签订，即具有法律效力。如果借款人未按时还款，出借人可以依据欠条向法院提起诉讼，要求借款人承担还款责任。
   • 欠条的内容应真实、合法，不得违反相关法律法规的规定。

4. 实际操作建议：

   • 在打欠条时，应详细写明借款金额、借款用途、还款期限、利息（如有）等条款，并由双方签字确认。
   • 保留好欠条原件，以便在需要时作为证据使用。

综上所述，儿子借母亲5万元，为了明确双方之间的债权债务关系，保护双方的合法权益，建议打欠条。如果双方在借款过程中有任何疑问或争议，可以及时咨询专业律师，以获取更具体的法律建议。