合作协议鉴定笔记是你的，你当然可以不认可其鉴定结果。但需要注意的是，不认可鉴定结果并不等同于鉴定结果无效或错误，这需要通过法律程序来进一步确认。

首先，我们要明确合作协议鉴定笔记的法律地位。鉴定笔记通常是在合作过程中，为了明确双方权利义务、解决争议或确认事实而进行的书面记录。然而，鉴定笔记本身并不具有法律效力，其效力需要依赖于法律程序的确认。

如果你对鉴定笔记的内容不认可，可以采取以下措施：

1. 提出异议：你可以向出具鉴定笔记的机构或个人提出异议，要求重新鉴定或解释鉴定依据。这通常需要在一定的期限内进行，并遵循相关程序规定。

2. 寻求法律救济：如果异议未能得到满意解决，你可以通过法律途径寻求救济。例如，在合同纠纷中，你可以向法院提起诉讼，请求法院对鉴定笔记进行审查并作出裁决。法院会根据法律规定和证据情况，对鉴定笔记的效力进行认定。

3. 准备证据：在提出异议或诉讼过程中，你需要准备充分的证据来支持你的主张。这包括但不限于合作过程中的相关文件、沟通记录、证人证言等。证据应当真实、合法、有效，并能够证明你的不认可理由。

总之，虽然你可以不认可合作协议鉴定笔记的内容，但需要通过法律程序来进一步确认其效力。在这个过程中，建议你咨询专业律师以获取更具体的法律建议和帮助。如果你有任何其他问题或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。