统一法人的两个单体药店之间调货，如果未按照相关法律法规和公司章程的规定进行，可能违反了公司法、药品管理法等相关规定，但具体是否违法及如何处罚，需要根据实际情况来判断。以下是详细分析：
公司内部管理规定：
- 统一法人的两个单体药店之间调货，首先应当遵循公司内部的管理规定。如果公司章程或内部管理制度中有关于货物调配的明确规定，而调货行为违反了这些规定，那么首先可能面临的是公司内部的纪律处分，如警告、罚款等。
药品管理法规定：
- 如果调货的商品是药品，那么必须严格遵守《药品管理法》及相关规定。药品的储存、运输、销售等都有严格的要求，如果调货过程中未按照这些要求操作，如未保持药品的储存条件、未进行正确的药品追溯等，那么可能构成违法，并面临药品监管部门的处罚，包括罚款、吊销药品经营许可证等。
公司法规定：
- 从公司法的角度来看，如果调货行为涉及到了公司的财务、会计记录的不真实、不准确，或者涉及到了公司资产的非法转移等，那么可能构成对公司法相关规定的违反。这种情况下，除了可能面临公司内部的纪律处分外，还可能受到工商部门的行政处罚，甚至可能触犯刑法，构成犯罪。
税务法规定：
- 如果调货行为涉及到了税收问题，如未按照税法规定申报纳税、逃避税收等，那么还可能构成对税务法规的违反，并面临税务部门的处罚，包括补税、罚款、滞纳金等。
综上所述，统一法人的两个单体药店之间调货是否违法及如何处罚，需要根据具体的调货行为、涉及的法律法规以及公司章程的规定来判断。如果调货行为合法合规，那么就不会面临任何处罚；如果调货行为违反了相关法律法规或公司章程的规定，那么就需要承担相应的法律责任。因此，在进行调货之前，建议详细咨询相关法律专业人士，确保调货行为的合法合规性。