对于在海关行政处罚初次违法免罚事项清单中的免罚行为，通常不会记录在案作为行政处罚记录。以下是对此问题的详细分析：

1. “初违免罚”政策的背景：

   • 新修订的《中华人民共和国海关行政处罚裁量基准(二)》及首次出台的《海关行政处罚“初次违法免罚”事项清单(二)》明确了“初次违法且危害后果轻微并及时改正”的情形可以免予行政处罚。

2. “初违免罚”的具体适用：

   • 当事人在清单内的违法行为发生前24个月内，无违反海关同一检验检疫业务领域监管规定的行政或刑事违法记录，且及时改正的，海关可以不予行政处罚。
   • 同时，海关会对当事人进行教育，以引导其今后合规经营。

3. 免罚记录的处理：

   • 由于“初违免罚”政策本身就是为了减轻企业负担、优化法治化营商环境而设立的，因此，对于符合免罚条件的违法行为，海关通常不会将其记录在案作为行政处罚记录。
   • 这意味着，该违法行为不会对企业的信用记录产生负面影响，也不会在后续的海关监管中被视为有行政处罚前科。

4. 政策的意义：

   • “初违免罚”政策不仅体现了海关执法的“刚柔并济”，还通过教育引导增强了企业的合规性意识。
   • 它有助于企业在今后的经营中建立长效合规机制，实现良性发展，同时也为海关执法水平的提升提出了更高要求。

综上所述，对于在海关行政处罚初次违法免罚事项清单中的免罚行为，企业可以放心，这通常不会作为其行政处罚记录被记录在案。然而，企业也应珍惜这次免罚的机会，加强内部管理，避免类似问题再次发生。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请直接向我提问。