如果交通运输执法证据不充分却处罚了当事人，执法人员可能需要承担相应的法律责任。具体来说：

1. 行政行为需证据充分：依据行政法规定，行政机关作出行政行为，包括处罚当事人，必须有充分的证据支持。若证据不足，直接作出处罚决定，是不符合法律规定的。

2. 补充调查义务：若发现证据不足，执法人员应及时进行补充调查，通过询问相关人员、调取监控等合法手段收集能证明违法事实的证据。这是执法人员的职责所在，也是确保执法公正、准确的重要环节。

3. 不得随意处罚：若经补充调查后，仍然无法证明当事人存在违法行为，执法人员应撤销案件或终止调查，不得对当事人实施处罚。这是执法公正性的体现，也是保护当事人合法权益的要求。

4. 可能承担的责任：如果执法人员明知证据不足却仍然处罚当事人，或者未进行充分的补充调查就草率作出处罚决定，那么他们可能会因此承担法律责任。这种责任可能包括行政责任，如被上级机关批评、处分等；甚至可能涉及刑事责任，如滥用职权罪等。

5. 国家赔偿：若当事人因证据不足的调查而遭受损失，他们有权依法申请国家赔偿。这是国家对于执法错误给当事人造成损失的一种补救措施。

综上所述，交通运输执法人员在执法过程中必须确保证据充分，不得随意处罚当事人。如果因证据不足而处罚了当事人，执法人员可能需要承担相应的法律责任。因此，执法人员在执法时应严谨、公正，确保每一起案件都经得起法律和历史的检验。