公积金房贷逾期一天且已过还款时间，应尽快进行偿还以避免进一步产生逾期费用和影响信用记录。具体偿还方式如下：
一. 对于采用自由还款方式的贷款：
- 通过线上平台或APP偿还：您可以通过北京公积金APP、北京通APP或个人网上业务平台办理偿还手续。在平台上提交相关信息并确认无误后，即可完成偿还。
- 通过住房公积金热线偿还：您还可以拨打12329住房公积金热线，按照语音提示或人工服务指导进行偿还操作。
- 通过政务服务便民自助终端偿还：前往附近的政务服务便民自助终端，按照屏幕提示进行偿还操作。
- 前往贷款业务柜台偿还：持本人身份证原件，在还款日以外的工作日，到北京住房公积金管理中心所属的十个远郊管理部、住房公积金贷款中心及受托办理个人住房贷款业务的银行代办点办理偿还手续。
例如，如果您选择通过北京公积金APP偿还，只需登录APP，找到相关偿还功能，按照提示操作即可。
二. 对于2005年1月1日之前发放（非自由还款方式）的住房公积金个人住房贷款：
- 您应尽快将逾期贷款款项存入还款卡中，以备银行补扣。建议实存款项大于偿还逾期贷款款项，以防因银行扣收还款卡的年费等费用造成银行无法足额扣收逾期贷款款项。
- 委托建行发放的住房公积金个人住房贷款在每周三和每月25日至月末最后一天进行补扣，委托其他银行发放的住房公积金个人住房贷款在每周三和还款日进行补扣。
我建议，在偿还逾期贷款后，您应密切关注后续的扣款情况，确保贷款已完全偿还，并避免再次出现逾期。同时，也可以考虑设置提醒或自动扣款功能，以减少未来逾期的风险。如有进一步需要，您可以继续咨询我。