自然人独资有限公司可以申请高新技术企业。具体分析如下：

一. 申请高新技术企业的条件

1. 核心自主知识产权：企业必须拥有核心自主知识产权，这是申请高新技术企业的关键条件之一。这意味着企业在技术方面必须有独特的、受法律保护的创新成果。

2. 产品或服务领域：企业所提供的产品或服务必须属于《国家重点支持的高新技术领域》。这一要求确保了企业的业务方向与国家的高新技术产业发展战略相一致。

3. 研发活动与技术成果转化：企业需要持续进行研究开发与技术成果转化，并形成企业核心自主知识产权。这体现了企业在技术创新和成果转化方面的活跃度和能力。

4. 研发人员比例：具有大学专科以上学历的研发人员占企业当年职工总数的比例不低于30%。这一要求反映了企业在人才培养和引进方面的投入，以及研发团队的实力。

5. 财务指标：除了上述条件外，企业还需满足一定的财务指标要求，如销售额、利润等。这些指标是评估企业经济实力和市场表现的重要依据。

二. 自然人独资有限公司的适用性

自然人独资有限公司，作为依法设立的企业法人，只要满足上述申请高新技术企业的条件，即可提出申请。法律并未对自然人独资有限公司申请高新技术企业设置特别的限制或障碍。

综上所述，自然人独资有限公司完全有资格申请高新技术企业，只要其能够满足相关条件，并按照规定的程序进行申请即可。如有进一步需要，您可以继续咨询我。