关于合同制员工违纪的处理办法，我可以从以下几个方面为你详细解答：

一、违纪判断与证据固定

首先，要判断员工的行为是否构成违纪，需将具体行为与企业制度中对于“违纪”的具体规定进行比对。企业内部的规章制度必须具有合法性、合理性及实操性，否则可能不具备约束力。在确认违纪行为后，用人单位应固定相关证据，如要求员工陈述违纪行为的时间、地点、人员、原因、经过及损害后果，并让员工签字确认；同时，对比企业内部制度中的“违纪行为”条款，交由员工知晓并进行书面确认。

二、处理依据与方式

1. 处理依据：

   • 违纪事实：及时调查，保留相关材料。
   • 法律依据：劳动法、公司内部规章制度及双方签署的协议或合同。
   • 正确界定员工的违纪行为，熟悉公司手册及规章制度，谨慎操作。

2. 处理方式：

   • 行政处分：警告、记过、记大过、降级、撤职、留用察看、开除。
   • 辞退（解除劳动合同）：即时辞退（因严重违纪而辞退）、预告辞退。
   • 除名：适用于劳动者无故连续旷工或一年内累计旷工达到约定天数而作的行政处理。
   • 经济处罚：扣工资不超过20%，或要求员工赔偿经济损失。

三、处理流程与注意事项

1. 处理流程：

   • 固定违纪行为的证据。
   • 确定是否构成“严重违反用人单位规章制度”。
   • 若构成，用人单位可以单方面解除劳动合同，但需按照法律规定的程序操作，如事先通知工会、出具解除劳动合同的证明等。

2. 注意事项：

   • 确保所有流程都合法、合理，并有充分的证据支持决定，否则可能面临违法解除劳动合同的法律后果。
   • 在辞退员工时，需特别注意《劳动合同法》第四十二条对特殊人群的保护，员工没有过错的，用人单位不能辞退。

四、特殊情况的法律建议

• 对于试用期内员工，不得随意辞退，否则员工有权要求恢复劳动关系。
• 辞退有过错的员工时，应有明确的事实依据和制度依据，并在员工手册或规章制度中对严重违纪的情形有明确规定。
• 辞退无过错的员工时，需提前通知并支付经济补偿金。

综上所述，处理合同制员工违纪问题时，用人单位应严格遵循法律法规和企业规章制度，确保处理过程合法、合理、有据可依。如有任何疑问或需要进一步的法律咨询，请随时向我提问。