伯父和侄女能做亲缘鉴定。具体分析如下：

一. 亲缘鉴定的范围与适用性

1. 亲缘鉴定的定义：亲缘鉴定是除亲子鉴定外的家族血缘鉴定，涵盖爷孙关系、叔侄关系、外祖母与外孙女的关系等。由此，伯父与侄女的关系也包含在内，可以进行亲缘鉴定。
2. 鉴定方式：虽然伯父与侄女无法进行亲子鉴定，但可以通过亲缘鉴定的方式来确认他们之间的血缘关系。这种鉴定同样基于遗传学原理，采用DNA分型检测技术。

二. 亲缘鉴定的法律与实际应用

1. 法律依据：虽然《中华人民共和国户口登记条例》中并未直接提及亲缘鉴定，但户口登记内容的变更或更正可能涉及亲缘关系的证明，此时亲缘鉴定报告可作为相关证明。
2. 实际应用：在没有直系亲属（如父亲）存在或无法直接进行亲子鉴定的情况下，伯父与侄女的亲缘鉴定可以作为一种辅助手段，来确认孩子与家族其他成员之间的血缘关系。

综上所述，伯父和侄女完全可以做亲缘鉴定来确认他们之间的血缘关系。如有进一步需要，您可以继续咨询我。