保密单位不让过账主要是出于对国家秘密和商业秘密的保护。以下是对此问题的详细分析：

一. 保密单位的性质与责任

1. 保密单位的定义：保密单位通常涉及国家秘密或商业秘密的保管与处理，这些秘密关乎国家安全、经济利益以及竞争优势。
2. 保密责任：根据相关法律法规，如《保守国家秘密法》和《反不正当竞争法》，保密单位有义务确保秘密信息不被泄露。

二. 过账可能带来的风险

1. 信息泄露风险：过账过程中，可能涉及财务信息的流转，这些信息可能间接或直接地透露出保密单位的核心业务、技术细节或客户资料，从而构成泄密。
2. 法律后果：一旦因过账导致秘密泄露，保密单位可能面临法律追究，包括但不限于行政处罚、经济赔偿，甚至刑事责任。

三. 保密单位的管理措施

1. 严格的财务管理制度：保密单位通常会建立严格的财务管理制度，限制财务信息的流转范围，确保信息仅在必要范围内传递。
2. 避免过账操作：为避免信息泄露风险，保密单位倾向于避免过账操作，或通过内部结算、专项账户等方式进行资金管理，以减少外部接触和泄露的可能性。

综上所述，保密单位不让过账是出于对国家秘密和商业秘密的严格保护，以防止信息泄露带来的法律风险和损害。这是保密单位履行其保密责任、维护国家安全和商业利益的重要举措。我建议保密单位应继续坚持这一原则，并不断完善内部管理制度，确保秘密信息的安全。如有进一步需要，您可以继续咨询我。