当建设单位拖欠施工单位工程款时，施工单位可以采取以下步骤来维护自身权益：

首先，友好协商是解决问题的首选方式。施工单位应主动与建设单位进行沟通，了解拖欠的原因，并尝试就还款事宜达成协议。这不仅能维护双方的合作关系，还有助于快速解决问题。在协商过程中，可以探讨分期付款的可能性，或者详细核对工程量、单价等数据，以确保双方对欠款金额无异议。

如果协商无果，施工单位可以依法行使建设工程价款优先受偿权。这意味着在建设工程折价或拍卖时，施工单位能优先获得相应价款。但请注意，行使该权利需严格遵循法定程序和期限。

同时，施工单位也可以追究建设单位的违约责任。根据双方签订的合同，施工单位可以要求建设单位支付逾期付款违约金等费用。在此过程中，收集各类相关证据至关重要，如施工合同、工程结算单、签证单、催款函等。这些证据在后续通过诉讼或仲裁解决纠纷时将起到关键作用。

如果决定通过法律途径解决问题，施工单位需要注意诉讼时效。一般来说，拖欠工程款的诉讼时效为三年。超过这个期限，债权将不再受法律保护。因此，施工单位应在规定时间内提起诉讼或申请仲裁。

在诉讼或仲裁过程中，为防止建设单位转移财产，施工单位可以申请财产保全。这将确保最终能顺利实现工程款债权。

另外，如果担心诉讼过程复杂且耗时较长，施工单位还可以考虑向仲裁机关提交仲裁申请。仲裁程序相对简单，耗时较短，且仲裁结果具有法律强制执行的效力。

对于一些拖欠较久、清欠较难的款项，施工单位还可以采取贴现方式，即将未到期的应收工程款以一定的折扣转让给金融机构，从而提前获得资金。或者也可以争取银行对建设项目的资金支持，通过申请买方信贷或卖方信贷来解决资金问题。

综上所述，施工单位在面对建设单位拖欠工程款时，应综合运用多种手段来维护自身权益。同时，也要注意保留相关证据、关注诉讼时效，并寻求专业法律支持以确保自身权益得到有效保障。